Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD3Q8IVD9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms