Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPFIBP1Q86W92 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP1Q86W92 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms