Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRRT2Q7Z6L0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRRT2Q7Z6L0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRRT2Q7Z6L0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRRT2Q7Z6L0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRRT2Q7Z6L0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRRT2Q7Z6L0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRRT2Q7Z6L0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT2Q7Z6L0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms