Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DHX29Q7Z478 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DHX29Q7Z478 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DHX29Q7Z478 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DHX29Q7Z478 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DHX29Q7Z478 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
DHX29Q7Z478 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms