Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSX7Q7RTT5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms