Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTOP3Q7RTS5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms