Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2BQ7L1I2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms