Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms