Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPUQ71F23 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms