Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM47EQ6ZV65 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms