Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LBX2Q6XYB7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LBX2Q6XYB7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms