Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMFQ6X4W1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms