Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms