Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCERG1LQ5VWI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms