Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYDE2Q5VT97 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYDE2Q5VT97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms