Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIF1Q5UIP0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIF1Q5UIP0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms