Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms