Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGAP40Q5TG30 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP40Q5TG30 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms