Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
CCDC18Q5T9S5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC18Q5T9S5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms