Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDK2Q58EX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms