Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRY2Q49AN0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRY2Q49AN0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRY2Q49AN0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms