Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT71Q3SY84 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT71Q3SY84 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms