Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms