Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C17orf58Q2M2W7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C17orf58Q2M2W7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms