Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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