Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85BQ15834 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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