Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC1Q15751 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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