Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRADDQ15628 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRADDQ15628 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms