Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDSNQ15517 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDSNQ15517 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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