Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT31Q15323 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms