Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRRQ15256 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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