Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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SETDB1Q15047 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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SETDB1Q15047 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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SETDB1Q15047 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETDB1Q15047 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETDB1Q15047 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETDB1Q15047 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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SETDB1Q15047 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETDB1Q15047 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETDB1Q15047 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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SETDB1Q15047 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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SETDB1Q15047 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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SETDB1Q15047 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETDB1Q15047 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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SETDB1Q15047 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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