Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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