Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SQLEQ14534 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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