Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNASE1L3Q13609 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNASE1L3Q13609 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms