Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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TOP3AQ13472 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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TOP3AQ13472 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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TOP3AQ13472 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TOP3AQ13472 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TOP3AQ13472 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TOP3AQ13472 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOP3AQ13472 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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