Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1Q13228 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SELENBP1Q13228 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SELENBP1Q13228 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms