Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDZK1IP1Q13113 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDZK1IP1Q13113 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms