Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH17Q12864 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH17Q12864 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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