Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YMR147WYMR147W 672 nt4.12□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 CUS2YNL286W 858 nt4.12□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 MVD1YNR043W 1191 nt4.12□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 YOR342CYOR342C 960 nt4.12□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 YDC1YPL087W 954 nt4.12□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 HOS2YGL194C 1359 nt4.12□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 TEL1YBL088C 8364 nt4.12□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 MUM3YOR298W 1440 nt4.12□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 AZR1YGR224W 1842 nt4.11□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 BNA6YFR047C 888 nt4.11□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 RAD27YKL113C 1149 nt4.11□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 LYS2YBR115C 4179 nt4.1□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 DCV1YFR012W 609 nt4.1□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 YGL262WYGL262W 528 nt4.1□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 VPS68YOL129W 555 nt4.1□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 SRB6YBR253W 366 nt4.1□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 LAS1YKR063C 1509 nt4.1□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 RRN11YML043C 1524 nt4.1□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 THI22YPR121W 1719 nt4.09□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 YCR023CYCR023C 1836 nt4.09□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 OCA4YCR095C 1089 nt4.09□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.09□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.09□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 TRM11YOL124C 1302 nt4.09□□□□□ -1.75
RRP42Q12277 SET4YJL105W 1683 nt4.09□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 SNF2YOR290C 5112 nt4.09□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 ADY3YDL239C 2373 nt4.09□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 MRPL7YDR237W 879 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 FLO8YER109C 2400 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 RPL24AYGL031C 468 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 EFB1YAL003W 621 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 MHO1YJR008W 1017 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 SEO1YAL067C 1782 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 GAS5YOL030W 1455 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YPL025CYPL025C 558 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 SPC105YGL093W 2754 nt4.08□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YND1YER005W 1893 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 FRT2YAL028W 1587 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 RPC53YDL150W 1269 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 API2YDR525W 330 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 COS4YFL062W 1140 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 COS3YML132W 1140 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 RPL15BYMR121C 615 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 CUZ1YNL155W 825 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 ARO7YPR060C 771 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 COS2YBR302C 1140 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YCL022CYCL022C 516 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 BBC1YJL020C 3474 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 SKM1YOL113W 1968 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 SAS10YDL153C 1833 nt4.07□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 OLE1YGL055W 1533 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 MAL13YGR288W 1422 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 PCL10YGL134W 1302 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 NCE103YNL036W 666 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 TOM7YNL070W 183 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 MRM1YOR201C 1239 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 COA2YPL189C-A 207 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 PRE2YPR103W 864 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YOL153CYOL153C 1746 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 KIC1YHR102W 3243 nt4.06□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 HST1YOL068C 1512 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YDL109CYDL109C 1944 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 MRS3YJL133W 945 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 PRM9YAR031W 897 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 AST1YBL069W 1290 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 VPS69YPR087W 321 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 POP4YBR257W 840 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 ECM32YER176W 3366 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 STB3YDR169C 1542 nt4.05□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 MSK1YNL073W 1731 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 RAD57YDR004W 1383 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 RPG1YBR079C 2895 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 PTC1YDL006W 846 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YDL094CYDL094C 510 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 THI13YDL244W 1023 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 THI11YJR156C 1023 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 RFU1YLR073C 603 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 TDA5YLR426W 981 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 NCE102YPR149W 522 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 TRS85YDR108W 2097 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 VAC7YNL054W 3498 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 VPS36YLR417W 1701 nt4.04□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 PDR5YOR153W 4536 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 PEX30YLR324W 1572 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 MRP4YHL004W 1185 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 SPC34YKR037C 888 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 ORM2YLR350W 651 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YBL010CYBL010C 843 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 SUI1YNL244C 327 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 DCS2YOR173W 1062 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YPL114WYPL114W 420 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 PBN1YCL052C 1251 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 SPO77YLR341W 1434 nt4.03□□□□□ -1.76
RRP42Q12277 YSH1YLR277C 2340 nt4.03□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 CDC48YDL126C 2508 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 LAP3YNL239W 1365 nt4.02□□□□□ -1.77
RRP42Q12277 BUD8YLR353W 1812 nt4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms