Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 SPT3YDR392W 1014 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SNM1YDR478W 597 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YIL171WYIL171W 330 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YPT53YNL093W 663 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 YNG1YOR064C 660 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 EKI1YDR147W 1605 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 SKG6YHR149C 2205 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 CEG1YGL130W 1380 nt3.72□□□□□ -1.81
USB1Q12208 PTR3YFR029W 2037 nt3.71□□□□□ -1.81
USB1Q12208 TFA1YKL028W 1449 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 MET12YPL023C 1974 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 JHD2YJR119C 2187 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YDR056CYDR056C 618 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 NKP2YLR315W 462 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 NMD4YLR363C 657 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YPL025CYPL025C 558 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 PEP4YPL154C 1218 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 SUA7YPR086W 1038 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 GCR1YPL075W 2358 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RSC3YDR303C 2658 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 OCT1YKL134C 2319 nt3.71□□□□□ -1.82
USB1Q12208 PSY4YBL046W 1326 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RXT3YDL076C 885 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 ATP5YDR298C 639 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YGL088WYGL088W 366 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 LOH1YJL038C 660 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RFC2YJR068W 1062 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 CNB1YKL190W 528 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 UIP3YAR027W 708 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YAR030CYAR030C 342 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YLR407WYLR407W 687 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RRN9YMR270C 1098 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 IDI1YPL117C 867 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 TIF5YPR041W 1218 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 PDR12YPL058C 4536 nt3.7□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RPP1AYDL081C 321 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YDL094CYDL094C 510 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 UBC1YDR177W 648 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YER134CYER134C 537 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 BNA6YFR047C 888 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RPL24AYGL031C 468 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RAD27YKL113C 1149 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 ACP1YKL192C 378 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 FMP46YKR049C 402 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YPL278CYPL278C 303 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 OLE1YGL055W 1533 nt3.69□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YCR023CYCR023C 1836 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 THI22YPR121W 1719 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 TRS85YDR108W 2097 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 KRE28YDR532C 1158 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 COX4YGL187C 468 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YGL188CYGL188C 174 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YNK1YKL067W 462 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YAR023CYAR023C 540 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 MAD3YJL013C 1548 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 LAS1YKR063C 1509 nt3.68□□□□□ -1.82
USB1Q12208 TAF7YMR227C 1773 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 PHO13YDL236W 939 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 FRA2YGL220W 363 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 GRE3YHR104W 984 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 ISY1YJR050W 708 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 NSE1YLR007W 1011 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RPS1BYML063W 768 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YNL217WYNL217W 981 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 MVD1YNR043W 1191 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YOL035CYOL035C 303 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YOL153CYOL153C 1746 nt3.67□□□□□ -1.82
USB1Q12208 SEG1YMR086W 2883 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 XKS1YGR194C 1803 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 LYP1YNL268W 1836 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 YER085CYER085C 522 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 TOM7YNL070W 183 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 PHM7YOL084W 2976 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 VPS68YOL129W 555 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 NAT3YPR131C 588 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 snR37snR37 386 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 POP4YBR257W 840 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 TEL1YBL088C 8364 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 BOI2YER114C 3123 nt3.66□□□□□ -1.82
USB1Q12208 RGP1YDR137W 1992 nt3.65□□□□□ -1.82
USB1Q12208 ENT1YDL161W 1365 nt3.65□□□□□ -1.82
USB1Q12208 MCD4YKL165C 2760 nt3.65□□□□□ -1.82
USB1Q12208 SMF1YOL122C 1728 nt3.65□□□□□ -1.82
USB1Q12208 AI5_BETAQ0075 1065 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SPI1YER150W 447 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 OAR1YKL055C 837 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 GPI12YMR281W 915 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YOR379CYOR379C 339 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RPG1YBR079C 2895 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 BDP1YNL039W 1785 nt3.65□□□□□ -1.83
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