Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 RPA43YOR340C 981 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 RNR1YER070W 2667 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 DRS1YLL008W 2259 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 TEL2YGR099W 2067 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 FAA1YOR317W 2103 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 ADP1YCR011C 3150 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 RPN2YIL075C 2838 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 MCM7YBR202W 2538 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 YOR1YGR281W 4434 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 CRZ1YNL027W 2037 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 SRP72YPL210C 1923 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 YPL216WYPL216W 3309 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 GTF1YGR102C 552 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 FLO5YHR211W 3228 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 PEX19YDL065C 1029 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 NSA2YER126C 786 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 HGH1YGR187C 1185 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 MAP1YLR244C 1164 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 PKH1YDR490C 2301 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 OAF1YAL051W 3144 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 TPS3YMR261C 3165 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 YCR006CYCR006C 474 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 YGL218WYGL218W 651 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 IDS2YJL146W 1410 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 SIP5YMR140W 1470 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 OLE1YGL055W 1533 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 ACE2YLR131C 2313 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 CKS1YBR135W 453 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 CYK3YDL117W 2658 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 MSD1YPL104W 1977 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 TUP1YCR084C 2142 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 GAL4YPL248C 2646 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 TMA19YKL056C 504 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 SHQ1YIL104C 1524 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 HIM1YDR317W 1245 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 VAC8YEL013W 1737 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 RSC1YGR056W 2787 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 CPA1YOR303W 1236 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 PIM1YBL022C 3402 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 ALR2YFL050C 2577 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 PUS7YOR243C 2031 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 SNF2YOR290C 5112 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 MKK1YOR231W 1527 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 YDL094CYDL094C 510 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 RRP17YDR412W 708 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 TCB3YML072C 4638 nt5.48□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 PHO90YJL198W 2646 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 YFR035CYFR035C 345 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 ARC15YIL062C 465 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 ADD66YKL206C 804 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 OCA5YHL029C 2040 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 RPL15AYLR029C 615 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 SRP101YDR292C 1866 nt5.47□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 KAP114YGL241W 3015 nt5.46□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 TFC6YDR362C 2019 nt5.46□□□□□ -1.53
TY1B-BRQ12193 CDS1YBR029C 1374 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt5.46□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 SYT1YPR095C 3681 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 MRPL51YPR100W 423 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 SVF1YDR346C 1446 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 SLI1YGR212W 1407 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 DIP2YLR129W 2832 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 POL3YDL102W 3294 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 TAF8YML114C 1533 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 RTT109YLL002W 1311 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 BUD14YAR014C 2130 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 RNH203YLR154C 333 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YTM1YOR272W 1383 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 DAM1YGR113W 1032 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YHR180WYHR180W 492 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 MBB1YJL199C 327 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 EIS1YMR031C 2532 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 SIT1YEL065W 1887 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 AKR1YDR264C 2295 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YNL095CYNL095C 1929 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 TRX3YCR083W 384 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 PPX1YHR201C 1194 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 USB1YLR132C 873 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 APC1YNL172W 5247 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 MDM1YML104C 3384 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YNR063WYNR063W 1824 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YCL075WYCL075W 441 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 PSF3YOL146W 585 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 FLC3YGL139W 2409 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 PTA1YAL043C 2358 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 PEX29YDR479C 1665 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 TEF4YKL081W 1239 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 SUB2YDL084W 1341 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YGR107WYGR107W 450 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1B-BRQ12193 YCF1YDR135C 4548 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 ERJ5YFR041C 888 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 RPB3YIL021W 957 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 ECM21YBL101C 3354 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 FAS2YPL231W 5664 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 UBP13YBL067C 2244 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 ARN2YHL047C 1863 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms