Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM27E3Q08E93 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM27E3Q08E93 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms