Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4DQ08499 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE4DQ08499 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4DQ08499 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms