Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F3Q08477 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms