Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GOLGA3Q08378 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3Q08378 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms