Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF8Q02556 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF8Q02556 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms