Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms