Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPIBQ01892 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIBQ01892 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms