Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC1RQ01726 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms